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中外計(jì)劃5年內(nèi)測序萬種微生物模式菌株

時(shí)間:2017-10-13來1源:未知 作者:馮麗妃

   第七屆世界微生物數(shù)據(jù)中心學(xué)術(shù)研討會于10月12至13日在京舉行。會上,由世界微生物數(shù)據(jù)中心(WDCM)和中科院微生物所牽頭,聯(lián)合全球12個(gè)國家的微生物資源保藏中心共同發(fā)起的全球微生物模式菌株基因組和微生物組測序合作計(jì)劃正式啟動。該計(jì)劃將建立覆蓋20多個(gè)國家30個(gè)主要微生物資源保藏中心的微生物、微生物組基因測序和功能挖掘合作網(wǎng)絡(luò)。

據(jù)悉,目前,世界上已知的微生物物種有1.4萬余種。此次合作計(jì)劃將在5年內(nèi)完成超過1萬種微生物模式菌株基因組測序,覆蓋超過目前已知90%的細(xì)菌模式菌株。計(jì)劃還將完成超過1000個(gè)微生物組的樣本測序,覆蓋人體、環(huán)境、海洋等主要方向。

“原來,我們很多時(shí)候是在下載和分享國際數(shù)據(jù);今天,我們的經(jīng)濟(jì)實(shí)力和研究基礎(chǔ)都上來了,應(yīng)該做一些讓自身受益的同時(shí)也讓國際收益的事情。”WDCM主任、中科院微生物所微生物資源與大數(shù)據(jù)中心馬俊才告訴《中國科學(xué)報(bào)》記者。此次測序可以讓微生物基因組學(xué)分類學(xué)更加完善,研究具體環(huán)境中微生物之間以及微生物與環(huán)境之間的相互作用,其分析結(jié)果有助于推動科學(xué)發(fā)展和產(chǎn)業(yè)應(yīng)用。

會上,歐洲微生物保藏組織理事長、來自匈牙利的Nelson Lima表示,目前全球微生物資源中心(mBRC)仍面臨諸多挑戰(zhàn),如全球已知微生物物種不足其多樣性的1%,mBRC未來研究中可獲得的分離菌數(shù)量就更少,如其中儲存的國際出版物中所描述或使用的細(xì)菌僅占總量的0.9%。此外,mBRC儲存的分離菌還存在質(zhì)量控制、數(shù)據(jù)整合等挑戰(zhàn)。這些都需要全球科學(xué)界以及科學(xué)界與生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)之間通力合作,打破陳規(guī)整合復(fù)雜的數(shù)據(jù),將科學(xué)知識轉(zhuǎn)化為創(chuàng)新性的解決辦法。

據(jù)介紹,通過實(shí)施此次合作計(jì)劃,我國將牽頭建立微生物領(lǐng)域的國際標(biāo)準(zhǔn),搭建微生物組學(xué)國際權(quán)威的數(shù)據(jù)平臺,組織和聯(lián)系微生物領(lǐng)域的國際隊(duì)伍,形成國際性的合作網(wǎng)絡(luò),有利于培育我國國際領(lǐng)軍戰(zhàn)略人才和青年才俊,建立生物資源挖掘、基礎(chǔ)前沿研究、技術(shù)創(chuàng)新到產(chǎn)業(yè)發(fā)展等一體化的研發(fā)應(yīng)用體系。

此次會議由中科院微生物所微生物資源與大數(shù)據(jù)中心和WDCM共同主辦,由中科院辦公廳、國際合作局、科技促進(jìn)發(fā)展局以及科技部國家科技基礎(chǔ)條件平臺中心、歐盟委員會研發(fā)創(chuàng)新總司生物經(jīng)濟(jì)理事會和世界微生物菌種保藏聯(lián)合會等共同支持,來自美、德、日、中等12個(gè)國家的微生物菌種保藏中心代表參會。

據(jù)介紹,WDCM隸屬國際生命科學(xué)聯(lián)盟下屬的世界微生物菌種保藏聯(lián)合會和聯(lián)合國教科文組織下屬的國際微生物資源中心。2010年,該中心落戶中科院微生物所,是我國生命科學(xué)領(lǐng)域重要的世界數(shù)據(jù)中心。 由其牽頭建立的全球微生物菌種目錄平臺,已有超過45個(gè)國家和地區(qū)的114個(gè)微生物資源保藏機(jī)構(gòu)通過該網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行數(shù)據(jù)和資源共享,是目前國際微生物資源領(lǐng)域最大的綜合數(shù)據(jù)平臺。

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