中國農(nóng)科院農(nóng)業(yè)基因組研究所簡介

中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院（深圳）農(nóng)業(yè)基因組研究所（簡稱“基因組所”）是由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院和深圳市共同打造的國家級研究所，主要從事生物大數(shù)據(jù)分析和基因組學(xué)研究，建立了分子生物學(xué)、測序和高性能計算三大平臺。研究所自2014年成立以來，踐行“躍居世界農(nóng)業(yè)科技高端，服務(wù)產(chǎn)業(yè)重大科技需求”國家使命，服務(wù)于粵港澳大灣區(qū)戰(zhàn)略部署和深圳市國際科技產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新中心建設(shè)，平臺測序通量和計算能力均為全國農(nóng)口單位最大，并依托研究平臺為全國60多家農(nóng)業(yè)科研單位提供基因組學(xué)服務(wù)，積累數(shù)據(jù)量超過2PB。組建了包括國家杰青等80余位高層次人才的近千人的科研隊伍，累計招收博士后130多名；建設(shè)了以組學(xué)技術(shù)為核心、輻射農(nóng)業(yè)、食品健康和生態(tài)方向的學(xué)科體系；獲批“嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)與技術(shù)廣東省實驗室深圳分中心”等創(chuàng)新載體；在Science, Nature, Cell, Nature Genetics等知名期刊上發(fā)表SCI論文400余篇，授權(quán)專利近50項。2019年、2020年連續(xù)兩年自然指數(shù)排名全國農(nóng)業(yè)類科研院所第一名；多項成果入選“中國生命科學(xué)十大進展”、“中國農(nóng)業(yè)科學(xué)十大進展”、“‘十三五’農(nóng)業(yè)科技十大標(biāo)志性成果”；獲得“何梁何利基金”獎、“周光召基礎(chǔ)科學(xué)獎”、“深圳經(jīng)濟特區(qū)建立40周年創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)和先進模范人物”、“深圳市市長獎”等獎勵。

基因組所下設(shè)食品科學(xué)中心，基于人類健康和食品組學(xué)大數(shù)據(jù)，圍繞“健康與食品”的關(guān)系，致力于三大研究主題：食品組學(xué)、腸道宏基因組與健康、人對食物性狀感知的機理。為推動產(chǎn)學(xué)研融合，中心正在籌建四大支持平臺：國際食品谷聯(lián)盟（產(chǎn)業(yè)孵化平臺），食品安全標(biāo)準(zhǔn)實驗室（實驗室測試平臺），國際食品政策智庫（專家顧問平臺），以及集成數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)（組學(xué)數(shù)據(jù)管理平臺）。此外，基因組所聯(lián)合深圳市相關(guān)部門提出了“深圳國際食品谷”規(guī)劃，已得到市政府印發(fā)，將構(gòu)建食品產(chǎn)學(xué)研協(xié)作生態(tài)，做出科技推動食品產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)型升級的先行示范。以建立世界食品科技創(chuàng)新策源地和未來食品健康先行示范區(qū)為目標(biāo)，深圳國際食品谷重點圍繞健康營養(yǎng)、食品安全、未來農(nóng)業(yè)三大領(lǐng)域，匯聚一批國際一流大學(xué)和科研院所，以及一流企業(yè)（研發(fā)）總部基地，營造未來產(chǎn)學(xué)研的協(xié)作創(chuàng)新生態(tài)，為大灣區(qū)和國家提供食品安全的重要支撐和推動食品產(chǎn)業(yè)的轉(zhuǎn)型升級，成為全球食品科技原始創(chuàng)新中心。

課題組簡介

賈耿介，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)基因組研究所，食品科學(xué)中心研究員、博士生導(dǎo)師、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院青年英才、深圳海外高層次人才、國際計算生物學(xué)協(xié)會(ISCB)會員、中國生物工程學(xué)會終身會員。2008年于中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)取得生物科學(xué)學(xué)士學(xué)位，2013年在新加坡國立大學(xué)和麻省理工學(xué)院聯(lián)合培養(yǎng)項目取得生物信息學(xué)博士學(xué)位。2011年在蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院訪問學(xué)習(xí)；2013–2016，擔(dān)任CGG公司數(shù)據(jù)科學(xué)家；2016–2020，在芝加哥大學(xué)醫(yī)學(xué)院進行醫(yī)學(xué)信息學(xué)博士后研究工作。近十年來共發(fā)表研究論文19篇，其中以第一作者在Nature Communications、Metabolites、BMC Systems Biology、Bioinformatics等學(xué)術(shù)期刊發(fā)表論文7篇。

研究領(lǐng)域包括健康與營養(yǎng)大數(shù)據(jù)挖掘、生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)、人工智能生物學(xué)、健康表型組與基因組數(shù)據(jù)分析、生物分子網(wǎng)絡(luò)建模。

通過開發(fā)針對多維度健康組學(xué)大數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析和機器學(xué)習(xí)方法，開展如下研究：

1.識別疾病的亞型分組和特異的并發(fā)癥模式，解析其病理學(xué)基礎(chǔ)，設(shè)計體外診斷和個性化營養(yǎng)干預(yù)方案；

2.闡釋疾病并發(fā)規(guī)律，解析其遺傳和飲食風(fēng)險，建立疾病并發(fā)的風(fēng)險預(yù)測模型。

課題組介紹網(wǎng)頁：https://www.jialab.org.cn

研發(fā)團隊現(xiàn)有18人，包括副研究員1名，博士后3名，博士研究生3名，碩士研究生7名，科研助理4名。團隊成員以生物信息和數(shù)學(xué)統(tǒng)計專業(yè)為主，還包括生物化學(xué)、食品科學(xué)、營養(yǎng)學(xué)等專業(yè)畢業(yè)生；團隊成員具有較強的數(shù)學(xué)建模和算法開發(fā)能力，并能通過細胞分子實驗進行假設(shè)驗證和分子機理探索。

招聘崗位：博士后

招聘需求：

面向生物信息學(xué)、計算機科學(xué)、生物統(tǒng)計、公共衛(wèi)生、醫(yī)學(xué)、營養(yǎng)學(xué)、數(shù)學(xué)方向，誠聘博士后3名、助理研究員1-2名、副研究員1名。

應(yīng)聘條件：

1.具有博士學(xué)位；

2.有代表性學(xué)術(shù)成果發(fā)表于國際重要刊物者優(yōu)先；

3.學(xué)術(shù)嚴(yán)謹(jǐn)，勤于思考，善于合作，有良好的溝通和中英文科技寫作能力。

崗位待遇：

1.博士后：按照深圳市、大鵬新區(qū)相關(guān)規(guī)定，博士后在站期間享受在站博士后生活補貼，具體金額以政府最新規(guī)定為準(zhǔn)（稅后36萬元，分2-3年發(fā)放）；除此之外，按照研究所的相關(guān)規(guī)定提供博士后的額外生活補助，6-8萬/年；

2.助理研究員：按照研究所相關(guān)規(guī)定和個人條件，14-20萬/年；

3.副研究員：按照研究所相關(guān)規(guī)定和個人條件，22-35萬/年；

4.五險一金和績效待遇；

5.可選擇落戶深圳市，其配偶及未成年子女可辦理隨遷入戶，并且享受深圳市和大鵬新區(qū)的新引進人才生活補貼，具體金額和發(fā)放方式以政府最新規(guī)定為準(zhǔn)；

6.符合條件者，可被認定為深圳市人才，獲得人才獎勵，認定標(biāo)準(zhǔn)和獎勵金額以政府最新規(guī)定為準(zhǔn)。

應(yīng)聘方式

請將個人簡歷（包含教育經(jīng)歷、研究經(jīng)歷、發(fā)表論文）、代表作和研究意向（或詳細計劃）以電子郵件形式發(fā)送到j(luò)iagengjie@caas.cn，并抄送znkyjyz@163.com，郵件主題請命名為“應(yīng)聘博后／助理研究員／副研究員+姓名 ”。

對所有應(yīng)聘材料，我們會嚴(yán)格保密。課題組在收到申請材料一個月內(nèi)會與初審合格者E-mail或電話聯(lián)系，邀請進行面試；資格審查未通過者，不再另行告知。

PI代表論文:

1.G. Jia, Y. Li, H. Zhang, I. Chattopadhyay, A. B. Jensen, D. R. Blair, L. Davis, P. N. Robinson, T. Dahlén, S. Brunak, M. Benson, G. Edgren, N. J. Cox, X. Gao, A. Rzhetsky*, Estimating Heritability and Genetic Correlations from Large Health Datasets in the Absence of Genetic Data, Nature Communications, 10, 5508 (2019).   (*corresponding authors)

2.G. Jia, G. Stephanopoulos, R. Gunawan*, Ensemble Kinetic Modeling of Metabolic Networks from Dynamic Metabolic Profiles, Metabolites, 2 (4), 891–912 (2012).

3.G. Jia, G. Stephanopoulos, R. Gunawan*, Incremental Parameter Estimation of Kinetic Metabolic Network Models, BMC Systems Biology, 6, 142 (2012).

4.G. Jia, G. Stephanopoulos, R. Gunawan*, Parameter Estimation of Kinetic Models from Metabolic Profiles: Two-phase Dynamic Decoupling Method, Bioinformatics, 27 (14), 1964–1970 (2011).

5.B. Chicoine, A. Rivelli, V. Fitzpatrick*, L. Chicoine, G. Jia, A. Rzhetsky, Prevalence of Common Disease Conditions in a Large Cohort of Individuals with Down Syndrome in the United States, Journal of Patient-Centered Research and Reviews, 2021, 8(2): 86-97.

6.X. Zhong*, Z. Yin, G. Jia, D. Zhou, Q. Wei, A. Faucon, P. Evans, E. R. Gamazon, B. Li, R. Tao, A. Rzhetsky, L. Bastarache, N. J. Cox*, Electronic Health Record Phenotypes Associated with Genetically Regulated Expression of CFTR and Application to Cystic Fibrosis, Genetics in Medicine, 22, 1191–1200 (2020).

7.C. Zhang, H. Tu, G. Jia, T. Mukhtar, V. Taylor, A. Rzhetsky, S. Tay*, Ultra-multiplexed Analysis of Single-cell Dynamics Reveals Logic Rules in Differentiation, Science Advances, 5 (2019).

為防止簡歷投遞丟失請抄送一份至：boshijob@126.com（郵件標(biāo)題格式：應(yīng)聘職位名稱+姓名+學(xué)歷+專業(yè)+中國博士人才網(wǎng)）